NEET Kunoichi to Nazeka Dousei Hajimemashita – Tsukasa Atsumi adalah seorang salaryman yang menjalani kehidupan biasa dan menyendiri. Suatu malam sepulang kerja, ia diselamatkan dari serangan iblis oleh seorang wanita misterius berpakaian ninja. Wanita itu memperkenalkan dirinya sebagai Shizuri Ideura, dan mengklaim bahwa iblis menargetkan orang-orang seperti Tsukasa yang memiliki Darah Samurai, serta bahwa klannya telah melindungi mereka secara diam-diam sejak lama.
Shizuri memperingatkan bahwa serangan akan semakin sering terjadi, dan Tsukasa pun membuat kesepakatan untuk memberinya tempat tinggal sebagai imbalan atas perlindungannya. Namun, ia segera mengetahui bahwa Shizuri ternyata adalah seorang hikkikomori yang gemar bermain video game saat tidak menjalankan tugas ninjanya. Seiring waktu mereka habiskan bersama, Tsukasa mulai menghargai kehadiran Shizuri—dan bisa jadi perasaannya tidak bertepuk sebelah tangan.
