Mahou Shoujo Lyrical Nanoha EXCEEDS: Gun Blaze Vengeance — Tiga puluh tahun yang lalu, kemunculan tiba-tiba makhluk asing invasif yang tidak dikenal hampir membawa dunia menuju kehancuran.
Sejak saat itu, umat manusia terus bertempur memperebutkan wilayah hidup dengan makhluk-makhluk yang dikenal sebagai Spesies Invasi. Meski keselamatan manusia masih berhasil dipertahankan, dunia tetap berada di ambang kehancuran. Di tengah ancaman kematian dan kehancuran yang terus membayangi, orang-orang menjalani kehidupan sehari-hari dengan mengabaikan bahaya yang selalu ada di sekitar mereka. Untuk menghadapi situasi tersebut, Perserikatan Bangsa-Bangsa membentuk organisasi EXCEEDS yang bertugas menyelidiki sekaligus menanggulangi berbagai ancaman yang ditimbulkan oleh Spesies Invasi.
Kisah ini dimulai di negara kepulauan Mizuho yang terletak di kawasan Timur Jauh. Di sana tinggal Shiina Kuze, seorang pemburu muda yang bertugas membasmi Spesies Invasi dan menetap di sebuah pulau terpencil. Shiina hanya menginginkan kehidupan yang tenang bersama satu-satunya keluarga yang dimilikinya, adik perempuannya, Setsuna. Namun, rutinitas damai itu berubah ketika sebuah insiden tak terduga menyeretnya ke dalam konflik yang jauh lebih besar.
